莱州市博物馆主要陈列有《郑道昭纪念馆》《中国书法简史》《莱州文采》等基本展厅。
重要藏品有汉代出土的大型铜质盐官印，发现的明《永乐大典》门制类首册两卷乃稀世珍宝（馆藏复制件）。还有隋唐时期的独木舟，当地名书画家如明代刘耳枝，清代翟云升、张士保等人字画，西汉灰陶马，魏晋陶虎子，清乾隆《枯木昏鸦图轴》等。另外收藏现代著名书画家舒同、赵朴初、刘海栗、沙孟海、谢稚柳、方济众、黄胄等百余人书画作品及日本书道界名人书作。
年至年，莱州市博物馆考察了全国重点文物保护单位——云峰山摩崖石刻保护工程，由国家拨款和地方筹资，分两期工程对云峰山上所有北朝刻石增建了仿古建式保护设施。新建了“郑文公下碑亭”、“论经书诗阁”、“观海童诗亭”、“云峰牌楼”、“云峰殿”等。其所建仿古建筑保护设施与秀美的云峰山交相辉映，体现了与周围环境的和谐美，并形成景观。
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